Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxd10P28359 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd10P28359 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms