Protein–RNA interactions for Protein: P28334

Htr1b, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1bP28334 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Htr1bP28334 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Htr1bP28334 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Htr1bP28334 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms