Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsgP28293 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsgP28293 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtsgP28293 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtsgP28293 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsgP28293 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtsgP28293 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsgP28293 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsgP28293 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsgP28293 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms