Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb3P28231 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gjb3P28231 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms