Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjb1P28230 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb1P28230 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms