Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpbP27048 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpbP27048 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpbP27048 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpbP27048 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpbP27048 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpbP27048 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpbP27048 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpbP27048 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpbP27048 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpbP27048 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpbP27048 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpbP27048 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpbP27048 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpbP27048 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms