Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh1a1P24549 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a1P24549 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms