Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd11P23813 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd11P23813 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd11P23813 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
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