Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfyaP23708 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfyaP23708 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfyaP23708 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfyaP23708 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfyaP23708 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfyaP23708 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfyaP23708 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms