Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja1P23242 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gja1P23242 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja1P23242 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja1P23242 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja1P23242 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gja1P23242 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja1P23242 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gja1P23242 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.1 ms