Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmnb2P21619 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lmnb2P21619 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmnb2P21619 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms