Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb4P21440 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb4P21440 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb4P21440 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms