Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkcaP20444 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcaP20444 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms