Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfaP20033 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms