Protein–RNA interactions for Protein: P19473

Trap1a, Tumor rejection antigen P815A, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1aP19473 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trap1aP19473 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trap1aP19473 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trap1aP19473 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms