Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ifrd1P19182 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifrd1P19182 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifrd1P19182 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms