Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rps6ka3P18654 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps6ka3P18654 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rps6ka3P18654 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rps6ka3P18654 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rps6ka3P18654 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rps6ka3P18654 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rps6ka3P18654 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka3P18654 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka3P18654 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka3P18654 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps6ka3P18654 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms