Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PcnaP17918 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PcnaP17918 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PcnaP17918 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PcnaP17918 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PcnaP17918 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PcnaP17918 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcnaP17918 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcnaP17918 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcnaP17918 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcnaP17918 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PcnaP17918 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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