Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcna1P16388 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcna1P16388 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna1P16388 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna1P16388 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms