Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scd1P13516 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scd1P13516 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scd1P13516 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scd1P13516 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scd1P13516 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scd1P13516 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scd1P13516 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scd1P13516 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scd1P13516 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scd1P13516 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scd1P13516 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scd1P13516 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scd1P13516 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scd1P13516 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scd1P13516 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scd1P13516 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms