Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calb1P12658 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calb1P12658 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calb1P12658 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calb1P12658 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calb1P12658 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calb1P12658 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms