Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaraP11416 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RaraP11416 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RaraP11416 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RaraP11416 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RaraP11416 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RaraP11416 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaraP11416 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RaraP11416 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RaraP11416 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RaraP11416 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RaraP11416 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RaraP11416 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RaraP11416 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaraP11416 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaraP11416 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaraP11416 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaraP11416 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaraP11416 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaraP11416 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaraP11416 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaraP11416 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaraP11416 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaraP11416 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaraP11416 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaraP11416 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RaraP11416 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RaraP11416 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RaraP11416 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RaraP11416 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RaraP11416 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RaraP11416 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RaraP11416 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RaraP11416 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RaraP11416 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RaraP11416 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RaraP11416 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RaraP11416 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RaraP11416 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RaraP11416 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RaraP11416 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RaraP11416 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RaraP11416 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaraP11416 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RaraP11416 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RaraP11416 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RaraP11416 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RaraP11416 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RaraP11416 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RaraP11416 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RaraP11416 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RaraP11416 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RaraP11416 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RaraP11416 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RaraP11416 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RaraP11416 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RaraP11416 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RaraP11416 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RaraP11416 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RaraP11416 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaraP11416 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaraP11416 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaraP11416 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaraP11416 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaraP11416 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaraP11416 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaraP11416 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaraP11416 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaraP11416 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaraP11416 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaraP11416 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms