Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd4P10628 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd4P10628 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms