Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P10404 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P10404 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P10404 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P10404 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P10404 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P10404 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P10404 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
P10404 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P10404 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P10404 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P10404 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P10404 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P10404 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P10404 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P10404 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P10404 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P10404 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P10404 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P10404 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P10404 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P10404 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P10404 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P10404 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P10404 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P10404 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P10404 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P10404 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P10404 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P10404 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P10404 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
P10404 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P10404 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P10404 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P10404 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P10404 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P10404 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P10404 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P10404 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P10404 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P10404 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P10404 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P10404 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P10404 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P10404 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
P10404 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P10404 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P10404 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P10404 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P10404 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P10404 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P10404 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P10404 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P10404 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P10404 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P10404 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P10404 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P10404 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P10404 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P10404 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P10404 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P10404 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
P10404 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P10404 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P10404 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
P10404 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P10404 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P10404 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P10404 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P10404 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P10404 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P10404 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P10404 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P10404 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P10404 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
P10404 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
P10404 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P10404 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
P10404 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P10404 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P10404 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P10404 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P10404 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P10404 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P10404 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P10404 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P10404 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms