Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd8bP10300 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd8bP10300 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd8bP10300 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd8bP10300 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd8bP10300 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd8bP10300 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd8bP10300 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd8bP10300 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd8bP10300 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd8bP10300 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms