Protein–RNA interactions for Protein: P0CB42

Alkbh1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh1P0CB42 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Alkbh1P0CB42 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkbh1P0CB42 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alkbh1P0CB42 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Alkbh1P0CB42 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh1P0CB42 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh1P0CB42 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh1P0CB42 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh1P0CB42 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh1P0CB42 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh1P0CB42 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh1P0CB42 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms