Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3P09920 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3P09920 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3P09920 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3P09920 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3P09920 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csf3P09920 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf3P09920 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf3P09920 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Csf3P09920 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3P09920 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3P09920 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csf3P09920 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3P09920 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3P09920 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms