Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa5P09021 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms