Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NeflP08551 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NeflP08551 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NeflP08551 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NeflP08551 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NeflP08551 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NeflP08551 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NeflP08551 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NeflP08551 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NeflP08551 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NeflP08551 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NeflP08551 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NeflP08551 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NeflP08551 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NeflP08551 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NeflP08551 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NeflP08551 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NeflP08551 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NeflP08551 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NeflP08551 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NeflP08551 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NeflP08551 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NeflP08551 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NeflP08551 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NeflP08551 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NeflP08551 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NeflP08551 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NeflP08551 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NeflP08551 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NeflP08551 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NeflP08551 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NeflP08551 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NeflP08551 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NeflP08551 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NeflP08551 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NeflP08551 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NeflP08551 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NeflP08551 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NeflP08551 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NeflP08551 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NeflP08551 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NeflP08551 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NeflP08551 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NeflP08551 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NeflP08551 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NeflP08551 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NeflP08551 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NeflP08551 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NeflP08551 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NeflP08551 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NeflP08551 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NeflP08551 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NeflP08551 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NeflP08551 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NeflP08551 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NeflP08551 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NeflP08551 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NeflP08551 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NeflP08551 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NeflP08551 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NeflP08551 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NeflP08551 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NeflP08551 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NeflP08551 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NeflP08551 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NeflP08551 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NeflP08551 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NeflP08551 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NeflP08551 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NeflP08551 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NeflP08551 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NeflP08551 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NeflP08551 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NeflP08551 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NeflP08551 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NeflP08551 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NeflP08551 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NeflP08551 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NeflP08551 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NeflP08551 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NeflP08551 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NeflP08551 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NeflP08551 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NeflP08551 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NeflP08551 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NeflP08551 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NeflP08551 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NeflP08551 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NeflP08551 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NeflP08551 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NeflP08551 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NeflP08551 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NeflP08551 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NeflP08551 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NeflP08551 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NeflP08551 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NeflP08551 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NeflP08551 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NeflP08551 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NeflP08551 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms