Protein–RNA interactions for Protein: P07321

Epo, Erythropoietin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpoP07321 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EpoP07321 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EpoP07321 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EpoP07321 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EpoP07321 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EpoP07321 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EpoP07321 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EpoP07321 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EpoP07321 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EpoP07321 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EpoP07321 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EpoP07321 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EpoP07321 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EpoP07321 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EpoP07321 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EpoP07321 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EpoP07321 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EpoP07321 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EpoP07321 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EpoP07321 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EpoP07321 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EpoP07321 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EpoP07321 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EpoP07321 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EpoP07321 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EpoP07321 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EpoP07321 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EpoP07321 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EpoP07321 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EpoP07321 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EpoP07321 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EpoP07321 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EpoP07321 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EpoP07321 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EpoP07321 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EpoP07321 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EpoP07321 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EpoP07321 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EpoP07321 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EpoP07321 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EpoP07321 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EpoP07321 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EpoP07321 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EpoP07321 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EpoP07321 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EpoP07321 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EpoP07321 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EpoP07321 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EpoP07321 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EpoP07321 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EpoP07321 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EpoP07321 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EpoP07321 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EpoP07321 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EpoP07321 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EpoP07321 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EpoP07321 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EpoP07321 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EpoP07321 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EpoP07321 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EpoP07321 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EpoP07321 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EpoP07321 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EpoP07321 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EpoP07321 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EpoP07321 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EpoP07321 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EpoP07321 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EpoP07321 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EpoP07321 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EpoP07321 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EpoP07321 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EpoP07321 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EpoP07321 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EpoP07321 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EpoP07321 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EpoP07321 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EpoP07321 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EpoP07321 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EpoP07321 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EpoP07321 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms