Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SparcP07214 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SparcP07214 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SparcP07214 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SparcP07214 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SparcP07214 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SparcP07214 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SparcP07214 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SparcP07214 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SparcP07214 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SparcP07214 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SparcP07214 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SparcP07214 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SparcP07214 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SparcP07214 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SparcP07214 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SparcP07214 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SparcP07214 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SparcP07214 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SparcP07214 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SparcP07214 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SparcP07214 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SparcP07214 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SparcP07214 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SparcP07214 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SparcP07214 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SparcP07214 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SparcP07214 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SparcP07214 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SparcP07214 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SparcP07214 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SparcP07214 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SparcP07214 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SparcP07214 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SparcP07214 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SparcP07214 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SparcP07214 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SparcP07214 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SparcP07214 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SparcP07214 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SparcP07214 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SparcP07214 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SparcP07214 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SparcP07214 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SparcP07214 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SparcP07214 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SparcP07214 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SparcP07214 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SparcP07214 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SparcP07214 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SparcP07214 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SparcP07214 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SparcP07214 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SparcP07214 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SparcP07214 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms