Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrlP06879 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrlP06879 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrlP06879 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrlP06879 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrlP06879 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrlP06879 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrlP06879 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrlP06879 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrlP06879 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrlP06879 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrlP06879 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrlP06879 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrlP06879 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrlP06879 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrlP06879 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrlP06879 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrlP06879 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrlP06879 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrlP06879 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrlP06879 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrlP06879 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PrlP06879 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrlP06879 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrlP06879 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrlP06879 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrlP06879 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrlP06879 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrlP06879 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrlP06879 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrlP06879 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrlP06879 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrlP06879 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrlP06879 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrlP06879 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrlP06879 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrlP06879 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrlP06879 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrlP06879 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrlP06879 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrlP06879 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrlP06879 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrlP06879 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrlP06879 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrlP06879 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrlP06879 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrlP06879 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrlP06879 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrlP06879 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrlP06879 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrlP06879 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrlP06879 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrlP06879 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrlP06879 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrlP06879 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PrlP06879 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PrlP06879 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrlP06879 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrlP06879 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrlP06879 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrlP06879 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PrlP06879 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrlP06879 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrlP06879 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrlP06879 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrlP06879 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrlP06879 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrlP06879 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrlP06879 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrlP06879 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrlP06879 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrlP06879 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrlP06879 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrlP06879 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrlP06879 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrlP06879 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrlP06879 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrlP06879 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrlP06879 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrlP06879 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrlP06879 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrlP06879 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrlP06879 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrlP06879 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrlP06879 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrlP06879 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrlP06879 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrlP06879 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrlP06879 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrlP06879 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrlP06879 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrlP06879 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrlP06879 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PrlP06879 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrlP06879 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrlP06879 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrlP06879 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrlP06879 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrlP06879 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrlP06879 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms