Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa4P06728 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa4P06728 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms