Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06330 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06330 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06330 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06330 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06330 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06330 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06330 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06330 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06330 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06330 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06330 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06330 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06330 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06330 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06330 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06330 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06330 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06330 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06330 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06330 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06330 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06330 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06330 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06330 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06330 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06330 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06330 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06330 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06330 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P06330 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P06330 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06330 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06330 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06330 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06330 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06330 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06330 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06330 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06330 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06330 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06330 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06330 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06330 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06330 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06330 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06330 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06330 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06330 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06330 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06330 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06330 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06330 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06330 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06330 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06330 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1393.8 ms