Protein–RNA interactions for Protein: P06328

Ig heavy chain V region VH558 B4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06328 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06328 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06328 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06328 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06328 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06328 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06328 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P06328 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06328 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06328 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06328 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P06328 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06328 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06328 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06328 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06328 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06328 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06328 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06328 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06328 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06328 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06328 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06328 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06328 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06328 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06328 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06328 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06328 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06328 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06328 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06328 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06328 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06328 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06328 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P06328 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P06328 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06328 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06328 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06328 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06328 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06328 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06328 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06328 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06328 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P06328 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06328 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06328 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P06328 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06328 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06328 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06328 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06328 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06328 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06328 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06328 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06328 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms