Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myl1P05977 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myl1P05977 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myl1P05977 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Myl1P05977 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myl1P05977 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myl1P05977 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Myl1P05977 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myl1P05977 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Myl1P05977 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Myl1P05977 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Myl1P05977 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Myl1P05977 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Myl1P05977 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Myl1P05977 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Myl1P05977 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Myl1P05977 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms