Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-Eb1P04230 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
H2-Eb1P04230 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms