Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
P04212 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04212 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04212 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04212 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04212 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P04212 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04212 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04212 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04212 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04212 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04212 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04212 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04212 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04212 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04212 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04212 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04212 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04212 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04212 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04212 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04212 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04212 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04212 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04212 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04212 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P04212 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04212 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04212 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04212 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P04212 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04212 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04212 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04212 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04212 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04212 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P04212 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04212 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04212 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04212 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04212 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04212 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04212 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04212 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04212 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04212 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04212 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04212 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04212 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04212 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04212 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04212 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04212 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04212 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04212 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04212 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04212 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04212 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04212 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
P04212 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P04212 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04212 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04212 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04212 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04212 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04212 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04212 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04212 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04212 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04212 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04212 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04212 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04212 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04212 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04212 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04212 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04212 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P04212 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04212 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04212 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04212 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04212 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms