Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53P02340 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53P02340 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tp53P02340 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53P02340 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tp53P02340 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53P02340 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53P02340 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53P02340 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53P02340 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53P02340 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tp53P02340 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tp53P02340 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tp53P02340 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms