Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01915 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01915 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01915 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01915 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01915 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01915 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01915 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01915 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01915 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01915 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01915 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01915 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01915 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01915 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01915 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01915 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01915 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01915 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01915 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01915 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01915 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01915 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01915 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01915 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01915 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01915 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01915 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01915 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01915 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01915 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01915 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01915 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01915 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01915 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01915 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01915 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01915 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01915 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01915 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01915 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01915 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01915 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01915 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01915 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01915 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01915 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01915 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01915 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01915 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01915 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01915 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01915 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01915 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01915 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01915 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01915 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01915 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01915 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01915 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01915 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01915 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01915 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01915 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01915 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01915 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01915 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01915 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01915 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01915 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01915 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01915 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms