Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01820 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01820 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01820 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01820 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01820 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01820 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01820 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01820 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01820 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01820 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01820 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01820 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01820 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01820 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01820 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01820 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01820 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01820 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01820 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01820 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01820 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01820 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01820 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01820 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01820 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01820 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01820 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01820 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01820 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01820 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01820 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01820 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01820 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01820 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01820 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01820 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01820 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01820 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01820 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01820 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01820 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01820 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01820 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01820 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01820 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01820 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01820 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01820 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01820 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01820 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01820 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01820 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01820 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01820 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01820 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01820 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01820 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01820 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01820 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01820 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01820 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01820 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01820 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01820 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01820 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01820 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01820 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01820 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01820 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01820 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01820 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01820 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01820 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01820 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01820 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01820 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01820 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01820 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01820 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01820 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01820 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01820 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01820 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01820 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01820 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms