Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01791 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01791 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01791 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01791 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01791 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01791 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01791 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01791 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01791 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01791 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01791 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01791 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01791 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01791 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01791 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01791 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01791 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01791 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01791 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01791 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01791 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01791 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01791 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01791 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01791 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01791 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01791 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01791 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01791 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01791 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01791 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01791 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01791 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01791 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01791 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01791 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01791 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01791 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01791 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01791 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01791 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01791 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01791 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01791 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01791 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01791 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01791 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01791 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01791 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01791 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01791 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms