Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01790 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01790 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01790 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01790 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01790 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01790 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01790 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01790 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01790 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01790 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01790 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01790 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01790 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01790 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01790 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01790 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01790 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01790 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01790 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01790 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01790 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01790 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01790 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01790 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01790 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01790 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01790 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01790 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01790 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01790 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01790 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01790 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01790 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01790 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01790 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01790 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01790 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01790 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01790 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01790 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01790 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01790 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01790 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01790 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01790 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01790 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01790 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01790 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01790 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01790 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01790 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01790 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01790 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms