Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01757 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01757 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01757 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01757 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01757 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01757 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01757 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01757 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01757 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01757 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01757 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01757 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01757 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01757 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01757 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01757 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01757 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01757 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01757 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01757 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01757 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01757 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01757 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01757 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01757 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01757 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01757 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01757 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01757 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01757 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01757 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01757 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01757 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01757 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01757 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01757 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01757 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01757 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01757 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01757 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01757 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01757 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01757 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01757 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01757 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01757 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01757 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01757 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01757 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01757 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01757 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01757 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms