Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01740 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01740 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01740 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01740 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01740 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
P01740 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01740 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01740 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01740 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01740 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01740 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01740 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01740 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01740 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01740 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01740 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01740 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01740 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01740 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01740 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01740 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01740 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01740 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01740 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01740 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01740 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01740 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01740 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01740 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01740 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01740 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01740 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01740 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01740 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01740 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01740 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01740 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01740 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01740 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01740 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01740 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01740 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01740 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01740 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01740 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01740 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01740 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01740 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01740 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01740 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01740 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01740 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01740 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01740 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01740 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01740 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01740 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01740 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01740 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01740 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01740 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
P01740 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01740 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01740 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01740 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01740 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01740 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01740 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01740 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
P01740 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01740 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01740 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01740 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01740 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01740 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01740 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01740 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01740 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01740 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01740 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01740 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01740 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01740 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01740 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01740 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01740 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01740 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01740 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01740 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01740 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01740 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01740 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01740 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
P01740 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01740 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01740 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01740 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01740 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
P01740 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms