Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01661 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01661 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01661 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01661 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01661 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01661 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01661 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01661 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01661 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01661 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01661 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01661 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01661 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01661 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01661 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01661 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01661 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01661 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01661 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01661 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01661 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01661 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01661 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01661 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01661 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01661 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01661 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01661 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01661 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01661 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01661 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01661 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01661 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01661 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01661 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01661 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01661 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P01661 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01661 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01661 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01661 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01661 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01661 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01661 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01661 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01661 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01661 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01661 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01661 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01661 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01661 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01661 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01661 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01661 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01661 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01661 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01661 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01661 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01661 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01661 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01661 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01661 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01661 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01661 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01661 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01661 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01661 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01661 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01661 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01661 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01661 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01661 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01661 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01661 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01661 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01661 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01661 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01661 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01661 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01661 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01661 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01661 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01661 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01661 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms