Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01660 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01660 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01660 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01660 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01660 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01660 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01660 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01660 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01660 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01660 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01660 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01660 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01660 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01660 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01660 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01660 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01660 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
P01660 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01660 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01660 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01660 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01660 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01660 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01660 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01660 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01660 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01660 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01660 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01660 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01660 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01660 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01660 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01660 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01660 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01660 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01660 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01660 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01660 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01660 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01660 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01660 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01660 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01660 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01660 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01660 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01660 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01660 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01660 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01660 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01660 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01660 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01660 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01660 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01660 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01660 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01660 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01660 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms