Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl20O89093 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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