Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn3O88990 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn3O88990 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn3O88990 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn3O88990 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn3O88990 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn3O88990 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actn3O88990 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn3O88990 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actn3O88990 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn3O88990 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms