Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hcn2O88703 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms